Longest Common Subsequence Aplicada à Comparação de Proteínas

  • Jessica Costa CEFET/RJ
  • Mateus Pereira CEFET/RJ
  • Kele Belloze CEFET/RJ
  • Eduardo Bezerra CEFET/RJ

Resumo


Este trabalho realiza uma comparação do desempenho de dois algoritmos na busca da maior subsequência comum (LCS - Longest Common Sub- sequence) entre sequências de proteínas de organismos vivos. Para isso foram utilizadas sequências de diversos tamanhos e realizados testes com os algoritmos de Wagner-Fischer e Needleman-Wunsch. Foi observado que conforme o tamanho da entrada cresce, o tempo de execução aumenta linearmente para ambos os algoritmos, contudo, apresentando melhores resultados para o algoritmo de Wagner-Fischer.

Palavras-chave: Bioinformática, Análise de Sequências, LCS

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Publicado
23/11/2021
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COSTA, Jessica; PEREIRA, Mateus; BELLOZE, Kele; BEZERRA, Eduardo. Longest Common Subsequence Aplicada à Comparação de Proteínas. In: ESCOLA REGIONAL DE INFORMÁTICA DO RIO DE JANEIRO (ERI-RJ), 4. , 2021, Online. Anais [...]. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação, 2021 . p. 103-110. DOI: https://doi.org/10.5753/eri-rj.2021.18781.