Estratégia Algorítmica para a Reconstrução e Validação da Estrutura Molecular de Variantes do SARS-CoV-2
Resumo
Aspectos matemático-computacionais e físico-químicos envolvidos na reconstrução da estrutura molecular tridimensional de proteínas do SARS-CoV-2 são abordados neste artigo, envolvendo a variante P.1 detectada em pacientes infectados em solo brasileiro, principalmente as do estado do Amazonas. Foi realizado um estudo sobre o impacto teórico da P.1 por intermédio da reconstrução estrutural de proteínas onde a mutagênese foi realizada computacionalmente e com o auxílio da implementação de um algoritmo de enumeração implícita de factibilidade, Branch-and-Prune, cujas soluções foram validadas através do uso do gráfico de Ramachandran. Desta forma, mesmo com a ausência de estruturas cristalográficas caracterizando estas mutações, pôde-se computacionalmente modelar uma estrutura tridimensional onde ao fim realizou-se o alinhamento estrutural com a cristalografia do complexo ACE2-RBD
Palavras-chave:
algoritmos, pandemia COVID-19, geometria de distâncias, SARS-CoV-2, reconstrução estrutural
Referências
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Publicado
18/07/2021
Como Citar
SOUZA, Clarice de; BESSA, João; FREITAS, Rosiane de; OLIVEIRA, Micael; MOTA, Kelson.
Estratégia Algorítmica para a Reconstrução e Validação da Estrutura Molecular de Variantes do SARS-CoV-2. In: BRAZILIAN E-SCIENCE WORKSHOP (BRESCI), 15. , 2021, Evento Online.
Anais [...].
Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação,
2021
.
p. 65-72.
ISSN 2763-8774.
DOI: https://doi.org/10.5753/bresci.2021.15790.
