Análise de erros de anotação de genes exclusivos
Resumo
Este artigo apresenta uma abordagem para a identificação de erros de anotação em genes exclusivos. O estudo apresenta ferramentas computacionais que possuem caráter genérico e podem ser utilizadas por pesquisadores e profissionais da área, bem como possibilitam uma maior confiabilidade em uma análise filogenética visando a identificação de genes exclusivos e suas origens. É apresentado um estudo de caso com genes de espécies de bactérias do gênero Xanthomonas, em que as ferramentas foram aplicadas.
Referências
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Matioli, S. R. (2001). Biologia Molecular e Evolução. Editora Holos, Ribeirão Preto.
Miyamoto, M. and Cracraft, J. (1991). Phylogenetic Analysis of DNA Sequences. Oxford University Press.
Pereira, V. M. Y. (2014). Montagem e análise de genomas a partir de metagenomas.
Master’s thesis, Universidade de São Paulo - Escola de Artes, Ciências e Humanidades.
Pereira, V. M. Y., Costa, C. I., and Digiampietri, L. A. (2014). Uma ferramenta baseada em algoritmos genéticos para a ordenação de montagens parciais de genomas. In VIII Brazilian e-Science Workshop (BRESCI2014).
Setubal, J. C. and Meidanis, J. (1997). Introduction to Computational Molecular Biology. PWS Publishing Company, Boston, EUA.
Zhang, Y., Jalan, N., Zhou, X., Goss, E., Jones, J. B., Setubal, J. C., Deng, X., , and Wang, N. (2015). Positive selection is the main driving force for evolution of citrus canker-causing xanthomonas. In ISME Journal.
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Master’s thesis, Universidade de São Paulo - Escola de Artes, Ciências e Humanidades.
Pereira, V. M. Y., Costa, C. I., and Digiampietri, L. A. (2014). Uma ferramenta baseada em algoritmos genéticos para a ordenação de montagens parciais de genomas. In VIII Brazilian e-Science Workshop (BRESCI2014).
Setubal, J. C. and Meidanis, J. (1997). Introduction to Computational Molecular Biology. PWS Publishing Company, Boston, EUA.
Zhang, Y., Jalan, N., Zhou, X., Goss, E., Jones, J. B., Setubal, J. C., Deng, X., , and Wang, N. (2015). Positive selection is the main driving force for evolution of citrus canker-causing xanthomonas. In ISME Journal.
Publicado
22/07/2017
Como Citar
WAGNER, Priscilla; MATTOS, Guilherme; DIGIAMPIETRI, Luciano.
Análise de erros de anotação de genes exclusivos. In: BRAZILIAN E-SCIENCE WORKSHOP (BRESCI), 11. , 2017, São Paulo.
Anais [...].
Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação,
2017
.
p. 1-4.
ISSN 2763-8774.
DOI: https://doi.org/10.5753/bresci.2017.9915.
