Análise do Comportamento das Operações de Entrada e Saída de um Workflow Científico de Alto Desempenho

• Lucas Cruz CEFET-RJ / LNCC
• Micaella Coelho LNCC
• Luiz Gadelha LNCC
• Carla Osthoff LNCC
• Kary Ocaña LNCC

DOI: https://doi.org/10.5753/eradrj.2021.18560

Resumo

Apresentamos uma análise do comportamento das operações de E/S da versão do workflow científico ParslRNA-Seq, acoplada a ambientes de CAD. O artigo traz discussões sobre a eleição de quais modificações na modelagem do workflow levam à melhora do desempenho e escalabilidade computacional, baseado em redução de gastos em operações de E/S.

Referências

Cruz, L., Coelho, M., Gadelha, L., Ocaña, K., and Osthoff, C. (2020). Avaliação de desempenho de um workflow científico para experimentos de rna-seq no supercomputador Santos Dumont. In Anais Estendidos do XXI Simpósio em Sistemas Computacionais de Alto Desempenho, pages 86–93, Porto Alegre, RS, Brasil. SBC.

Cruz, L., Coelho, M., Terra, R., Carvalho, D., Gadelha, L., Osthoff, C., and Ocaña, K. (2021). Workflows científicos de rna-seq em ambientes distribuídos de alto desempenho: Otimização de desempenho e análises de dados de expressão diferencial de genes. In Anais do XV Brazilian e-Science Workshop, pages 57–64, Porto Alegre, RS, Brasil. SBC.