Descrição da Primeira Fase do Workflow CellHeap para Análise Single-Cell RNA-seq

  • Gabriel P. T. Silva UERJ
  • Maria Clicia S. de Castro UERJ
  • Vanessa S. Silva Fiocruz
  • Fabrício A. B. Silva Fiocruz
DOI: https://doi.org/10.5753/eradrj.2021.18562

Resumo


Este artigo descreve a etapa inicial do workflow CellHeap utilizado na análise dos dados de sequenciamento de células únicas (scRNA-seq). A Fase 1 deste consiste no download e validação dos dados de amostras a serem utilizados nas fases subsequentes. Ao fim, são descritos algumas melhorias planejadas para esta etapa.

Referências

Silva, Vanessa S. et al. (2021) “CellHeap: a Workflow for Optimizing COVID-19 Single-Cell RNA-seq Data Processing in the Santos Dumont Supercomputer”, In: Proceedings of the Brazilian Symposium on Bioinformatcs, Lecture Notes in Bioinformatics serires, Springer, 2021.

Nicolás, Marisa F. e Costa, Maiana O. C. (2021) “Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq)”, Notas de Aula “Seminário Inova Covid19”, Brazil.
Publicado
29/11/2021
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SILVA, Gabriel P. T.; S. DE CASTRO, Maria Clicia; SILVA, Vanessa S.; SILVA, Fabrício A. B.. Descrição da Primeira Fase do Workflow CellHeap para Análise Single-Cell RNA-seq. In: ESCOLA REGIONAL DE ALTO DESEMPENHO DO RIO DE JANEIRO (ERAD-RJ), 7. , 2021, Evento Online. Anais [...]. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação, 2021 . p. 22-24. DOI: https://doi.org/10.5753/eradrj.2021.18562.