Estimativa de Tempo de Alinhamentos Biológicos na Nuvem

Resumo


A eficiência e o baixo custo da Computação em Nuvem dependem do gerenciamento de recursos computacionais. Um aspecto vital dessa tarefa é a estimativa do tempo de execução a fim de definir bons escalonamentos. Este artigo analisa a previsibilidade desse tempo de um serviço em Nuvem para o alinhamento de sequências de DNA projetado com o fim de utilizar recursos eficientemente e viabilizar a análise pelos cientistas dos milhares de alinhamentos que podem compor um único experimento. Entretanto, a qualidade da alocação de recursos é baseada na hipótese de que todos os alinhamentos do experimento demandam o mesmo tempo. Este trabalho visa à análise de fatores e os respectivos graus com que impactam o tempo de execução de cada alinhamento.
Palavras-chave: Alinhamento de sequências genéticas, Análise de desempenho, Ambiente de nuvem

Referências

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Publicado
21/06/2023
MILLS, Gabriel C.; CAVALCANTE, Sara M.; BOERES, Cristina; REBELLO, Vinod E. F.. Estimativa de Tempo de Alinhamentos Biológicos na Nuvem. In: ESCOLA REGIONAL DE ALTO DESEMPENHO DO RIO DE JANEIRO (ERAD-RJ), 8. , 2023, Rio de Janeiro/RJ. Anais [...]. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação, 2023 . p. 14-16. DOI: https://doi.org/10.5753/eradrj.2023.231704.