Avaliação da aplicação RAxML no Ambiente do Supercomputador SDumont

  • Guilherme Freire Faculdade de Educação Tecnológica do Estado do Rio de Janeiro / Laboratório Nacional de Computação Científica
  • Kary Ocaña Laboratório Nacional de Computação Científica
  • Micaella Coelho Laboratório Nacional de Computação Científica
  • Carla Osthoff Laboratório Nacional de Computação Científica
DOI: https://doi.org/10.5753/eradrj.2023.231711

Resumo


Este trabalho apresenta um estudo de desempenho desenvolvido para o software RAxML. O estudo avalia o tempo de execução do RAxML segundo os recursos computacionais alocados e os parâmetros de entrada da aplicação no ambiente do Supercomputador Santos Dumont (SDumont).
Palavras-chave: Bioinformática, Desempenho, Supercomputação

Referências

COELHO, M; OSTHOFF, C; OCAÑA, K. Avaliação do RAxML no Supercomputador Santos Dumont. In: ARTIGOS CURTOS - SIMPÓSIO BRASILEIRO DE BIOINFORMÁTICA (BSB) , 2018, Niterói. Anais Estendidos do XI Simpósio Brasileiro de Bioinformática. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação, 2018. p. 37-42

M. Coelho, G. Freire, K. Ocaña, C. Osthoff, M. Galheigo, A. R. Carneiro, F. Boito, P. Navaux, D. O. Cardoso. Desenvolvimento de um Framework de Aprendizado de Máquina no Apoio a Gateways Científicos Verdes, Inteligentes e Eficientes: BioinfoPortal como Caso de Estudo Brasileiro . XXIII Simpósio em Sistemas Computacionais de Alto Desempenho WSCAD 2022.
Publicado
21/06/2023
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FREIRE, Guilherme; OCAÑA, Kary; COELHO, Micaella; OSTHOFF, Carla. Avaliação da aplicação RAxML no Ambiente do Supercomputador SDumont. In: ESCOLA REGIONAL DE ALTO DESEMPENHO DO RIO DE JANEIRO (ERAD-RJ), 8. , 2023, Rio de Janeiro/RJ. Anais [...]. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação, 2023 . p. 23-25. DOI: https://doi.org/10.5753/eradrj.2023.231711.