Avaliação de Desempenho para Banco de Dados com Genoma em Nuvem Privada
Resumo
Os bancos de dados são ferramentas particularmente interessantes para a manipulação de dados gerados através do sequenciamento de DNA. Este artigo tem como objetivo avaliar o desempenho de três bancos de dados com cargas relacionadas ao sequenciamento de DNA: PostgreSQL e MySQL como bancos de dados relacionais e MongoDB como banco de dados NoSQL. Os resultados demonstram que o PostgreSQL se sobressai aos demais.Referências
Celesti, F., Celesti, A., Galletta, A., Fazio, M., and Villari, M. (2019). Optimizing the research of dna sequences in a nosql document database: A preliminary study. In 2019 IEEE Symposium on Computers and Communications (ISCC), pages 1153 – 1158, Barcelona, Spain. IEEE.
Karimi, R., Bellatreche, L., Girard, P., Boukorca, A., and Hajdu, A. (2014). Binos4dna: Bitmap indexes and nosql for identifying species with dna signatures through metaIn ITBAM 2014: Information Technology in Bioand Medical genomics samples. Informatics, pages 1 – 14, Munich, Germany. Springer, Cham.
Rockenbach, D. A., Anderle, N., Griebler, D., and Souza, S. (2018). Estudo Comparativo de Bancos de Dados NoSQL. Revista Eletrônica Argentina-Brasil de Tecnologias da Informação e da Comunicação (REABTIC), 1(8).
Vogel, A., Griebler, D., Maron, C. A. F., Schepke, C., and Fernandes, L. G. (2016). Private iaas clouds: A comparative analysis of opennebula, cloudstack and openstack. In 24th Euromicro International Conference on Parallel, Distributed and NetworkBased Processing (PDP), pages 672–679, Heraklion Crete, Greece. IEEE.
Karimi, R., Bellatreche, L., Girard, P., Boukorca, A., and Hajdu, A. (2014). Binos4dna: Bitmap indexes and nosql for identifying species with dna signatures through metaIn ITBAM 2014: Information Technology in Bioand Medical genomics samples. Informatics, pages 1 – 14, Munich, Germany. Springer, Cham.
Rockenbach, D. A., Anderle, N., Griebler, D., and Souza, S. (2018). Estudo Comparativo de Bancos de Dados NoSQL. Revista Eletrônica Argentina-Brasil de Tecnologias da Informação e da Comunicação (REABTIC), 1(8).
Vogel, A., Griebler, D., Maron, C. A. F., Schepke, C., and Fernandes, L. G. (2016). Private iaas clouds: A comparative analysis of opennebula, cloudstack and openstack. In 24th Euromicro International Conference on Parallel, Distributed and NetworkBased Processing (PDP), pages 672–679, Heraklion Crete, Greece. IEEE.
Publicado
14/04/2021
Como Citar
DOPKE, Luan; ROCKENBACH, Dinei; GRIEBLER, Dalvan.
Avaliação de Desempenho para Banco de Dados com Genoma em Nuvem Privada. In: ESCOLA REGIONAL DE ALTO DESEMPENHO DA REGIÃO SUL (ERAD-RS), 21. , 2021, Evento Online.
Anais [...].
Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação,
2021
.
p. 45-48.
ISSN 2595-4164.
DOI: https://doi.org/10.5753/eradrs.2021.14771.
