Avaliação de Desempenho para Banco de Dados com Genoma em Nuvem Privada

  • Luan Dopke SETREM
  • Dinei Rockenbach SETREM / PUCRS
  • Dalvan Griebler SETREM / PUCRS

Resumo


Os bancos de dados são ferramentas particularmente interessantes para a manipulação de dados gerados através do sequenciamento de DNA. Este artigo tem como objetivo avaliar o desempenho de três bancos de dados com cargas relacionadas ao sequenciamento de DNA: PostgreSQL e MySQL como bancos de dados relacionais e MongoDB como banco de dados NoSQL. Os resultados demonstram que o PostgreSQL se sobressai aos demais.

Referências

Celesti, F., Celesti, A., Galletta, A., Fazio, M., and Villari, M. (2019). Optimizing the research of dna sequences in a nosql document database: A preliminary study. In 2019 IEEE Symposium on Computers and Communications (ISCC), pages 1153 – 1158, Barcelona, Spain. IEEE.

Karimi, R., Bellatreche, L., Girard, P., Boukorca, A., and Hajdu, A. (2014). Binos4dna: Bitmap indexes and nosql for identifying species with dna signatures through metaIn ITBAM 2014: Information Technology in Bioand Medical genomics samples. Informatics, pages 1 – 14, Munich, Germany. Springer, Cham.

Rockenbach, D. A., Anderle, N., Griebler, D., and Souza, S. (2018). Estudo Comparativo de Bancos de Dados NoSQL. Revista Eletrônica Argentina-Brasil de Tecnologias da Informação e da Comunicação (REABTIC), 1(8).

Vogel, A., Griebler, D., Maron, C. A. F., Schepke, C., and Fernandes, L. G. (2016). Private iaas clouds: A comparative analysis of opennebula, cloudstack and openstack. In 24th Euromicro International Conference on Parallel, Distributed and NetworkBased Processing (PDP), pages 672–679, Heraklion Crete, Greece. IEEE.
Publicado
14/04/2021
Como Citar

Selecione um Formato
DOPKE, Luan; ROCKENBACH, Dinei; GRIEBLER, Dalvan. Avaliação de Desempenho para Banco de Dados com Genoma em Nuvem Privada. In: ESCOLA REGIONAL DE ALTO DESEMPENHO DA REGIÃO SUL (ERAD-RS), 21. , 2021, Evento Online. Anais [...]. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação, 2021 . p. 45-48. ISSN 2595-4164. DOI: https://doi.org/10.5753/eradrs.2021.14771.