Uma Ferramenta Baseada em Redes Neurais da Família ART para Predição de Epítopos Lineares de Células B

• Anthony F. La Marca UFMT
• Bruno S. de Oliveira UFMT
• Robson da S. Lopes UFMT

DOI: https://doi.org/10.5753/eri-mt.2024.245801

Resumo

O sistema público de saúde é dependente do uso de vacinas para imunizar a população de uma série de doenças infecciosas. Para desenvolvê-las e monitorar essas doenças utiliza-se métodos de diagnóstico precisos, que identificam regiões imunogênicas dentro de uma proteína. Esse processo é extremamente exigente e crucial, o que torna oportuno desenvolver ferramentas que possam o auxiliar. A presente proposta utiliza a Rede Neural Artificial (RNA) ARTMAP-FUZZY, treinada com epítopos anotados de sequências de aminoácidos de proteína, disponíveis no IEDB. Os dados foram pré-processados utilizando a escala de propensão de aminoácidos e sua proporção em epítopos positivos e negativos. Para o treinamento e teste, foi utilizado validação cruzada quíntupla e a área sob a curva (AUC) ROC para avaliar os resultados, atingindo um valor de 0,9289.

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