CelOWS: uma arquitetura orientada a serviços para definição, pesquisa e reuso de modelos biológicos

  • Ely Edison Matos UFJF
  • Fernanda Campos UFJF
  • Regina Braga UFJF

Resumo


A quantidade e variedade de informações geradas pelas ciências biológicas têm levado a um uso intenso de modelos na área. Neste contexto, tanto a modelagem matemática quanto a modelagem computacional necessitam de uma descrição acurada que permita que esses modelos sejam compartilhados, reutilizados e simulados tal como foram formulados por seus criadores. Neste artigo, apresentamos a Cell Component Ontology CelO, uma ontologia expressa em OWL-DL, que captura tanto a estrutura do modelo de uma célula quanto as propriedades dos seus componentes funcionais. A ontologia CelO é utilizada em uma arquitetura orientada a serviços para descrever, realizar inferências e consultar os modelos CellML. O objetivo principal da arquitetura é facilitar o reuso e a composição dos componentes existentes e permitir a validação semântica de novos modelos.

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Publicado
20/08/2008
MATOS, Ely Edison; CAMPOS, Fernanda; BRAGA, Regina. CelOWS: uma arquitetura orientada a serviços para definição, pesquisa e reuso de modelos biológicos. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE COMPONENTES, ARQUITETURAS E REUTILIZAÇÃO DE SOFTWARE (SBCARS), 2. , 2008, Porto Alegre/RS. Anais [...]. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação, 2008 . p. 107-120. DOI: https://doi.org/10.5753/sbcars.2008.46224.