ProtCool 2.0: um gerador de protocolo para ancoragem e simulações de dinâmica molecular em complexos proteína-ligante em versão web

  • Moisés P. Souza UNIFEI
  • Levi M. Magny UNIFEI
  • Fabiana C. Guedes UNIFEI
  • Carlos H. da Silveira UNIFEI

Resumo


A pandemia de COVID-19 deixou evidente a alta demanda por sistemas computacionais que agilizem a indicação de novos fármacos. Nesse sentido, compreender o comportamento dinâmico de complexos biomoleculares é algo fundamental. No entanto, a preparação de tais simulações é de grande complexidade, e seus inúmeros detalhes nem sempre são suficientemente destacados, comprometendo sua reprodutibilidade. Propõe-se aqui a ferramenta web ProtCool – um gerador de protocolos, focado na integração entre ancoragem e dinâmica molecular de complexos proteína-ligantes. Será demonstrado seu uso na simulação da interação entre acetilcolinesterase e galantamina, usada no tratamento do Alzheimer.

Referências

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Publicado
27/06/2023
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SOUZA, Moisés P.; MAGNY, Levi M.; GUEDES, Fabiana C.; SILVEIRA, Carlos H. da. ProtCool 2.0: um gerador de protocolo para ancoragem e simulações de dinâmica molecular em complexos proteína-ligante em versão web. In: FERRAMENTAS E APLICAÇÕES - SIMPÓSIO BRASILEIRO DE COMPUTAÇÃO APLICADA À SAÚDE (SBCAS), 23. , 2023, São Paulo/SP. Anais [...]. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação, 2023 . p. 168-173. ISSN 2763-8987. DOI: https://doi.org/10.5753/sbcas_estendido.2023.231153.