Desempenho de Workflows Científicos de Transcriptômica em Arquiteturas de Memória Distribuída e Compartilhada do Santos Dumont
Resumo
Experimentos científicos em larga escala são complexos devido à modelagem, execução e análise de grandes volumes de dados. Na bioinformática, esses experimentos são estruturados como workflows científicos, usando sistemas de gerência de workflows e computação de alto desempenho. Este artigo apresenta uma análise computacional do desempenho do workflow de transcriptômica ParslRNA-Seq entre arquiteturas com memória distribuída e memória compartilhada mais recentes do supercomputador Santos Dumont, demonstrando como a escolha das máquinas pode influenciar o desempenho.Referências
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Publicado
23/10/2024
Como Citar
EMIDIO, Albert; SOARES, Reiglan; CRUZ, Lucas; COELHO, Micaella; OCAÑA, Kary; OSTHOFF, Carla; CARVALHO, Diego.
Desempenho de Workflows Científicos de Transcriptômica em Arquiteturas de Memória Distribuída e Compartilhada do Santos Dumont. In: WORKSHOP DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA - SIMPÓSIO EM SISTEMAS COMPUTACIONAIS DE ALTO DESEMPENHO (SSCAD), 25. , 2024, São Carlos/SP.
Anais [...].
Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação,
2024
.
p. 97-104.
DOI: https://doi.org/10.5753/sscad_estendido.2024.244368.
