Gerência e Análises de Workflows aplicados a Redes Filogenéticas de Genomas de Dengue no Brasil
Resumo
Processos evolutivos e dispersão de genomas de Dengue no Brasil são relevantes na direção do impacto e vigilância endemo-epidêmico e social de arboviroses emergentes. Árvores e redes filogenéticas permitem exibir eventos evolutivos e reticulados em vírus originados pela alta diversidade e taxa de mutação de recombinação homóloga frequente. Apresentamos um workflow científico paralelo e distribuído para redes filogenéticas desenhado para trabalhar com a diversidade de ferramentas e recursos em experimentos da biologia computacional e acoplados a ambientes de computação de alto desempenho. Apresentamos uma melhoria no tempo de execução de aproximadamente 5 vezes em comparação com a execução sequencial em análises de genomas de dengue e com identificação de eventos de recombinação.
Palavras-chave:
redes filogenéticas, dengue, workflows científicos, computação de alto desempenho
Referências
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Publicado
18/07/2021
Como Citar
TERRA, Rafael; COELHO, Micaella; CRUZ, Lucas; GARCIA-ZAPATA, Marco; GADELHA, Luiz; OSTHOFF, Carla; CARVALHO, Diego; OCAÑA, Kary.
Gerência e Análises de Workflows aplicados a Redes Filogenéticas de Genomas de Dengue no Brasil. In: BRAZILIAN E-SCIENCE WORKSHOP (BRESCI), 15. , 2021, Evento Online.
Anais [...].
Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação,
2021
.
p. 49-56.
ISSN 2763-8774.
DOI: https://doi.org/10.5753/bresci.2021.15788.
