Desempenho de Workflows Multithreading no Supercomputador SDumont em Experimentos de RNA-Seq

  • Lucas Cruz CEFET/RJ
  • Micaella Coelho CEFET/RJ
  • Luiz Gadelha LNCC
  • Kary Ocaña LNCC
  • Carla Osthoff LNCC

Resumo

Este artigo apresenta uma análise comparativa de desempenho do workflow científico ParslRNA-Seq, sobre a parametrização multithreading do Parsl e do Bowtie, respectivamente. A fim de garantir o uso racional e alocação eficiente dos recursos computacionais no Supercomputador Santos Dumont.

Referências

Cruz, L., Coelho, M., Gadelha, L., Ocaña, K., and Osthoff, C. (2020). Avaliação de desempenho de um workflow cientı́fico para experimentos de rna-seq no supercomputador santos dumont. In Workshop de Iniciação Cientı́fica do XXI Simpósio em Sistemas Computacionais de Alto Desempenho. (Aceito em processo de publicação).
Publicado
2020-11-30
Como Citar
CRUZ, Lucas et al. Desempenho de Workflows Multithreading no Supercomputador SDumont em Experimentos de RNA-Seq. Anais da Escola Regional de Alto Desempenho do Rio de Janeiro (ERAD-RJ), [S.l.], p. 54-56, nov. 2020. ISSN 0000-0000. Disponível em: <https://sol.sbc.org.br/index.php/eradrj/article/view/14520>. Acesso em: 18 maio 2024. doi: https://doi.org/10.5753/eradrj.2020.14520.
Seção
Fórum de Iniciação Científica