GTACG: Um arcabouço computacional focado em genômica comparativa de bactérias de um mesmo ramo evolutivo
Resumo
Neste trabalho é apresentado o GTACG: um arcabouço computacional para genômica comparativa com foco em uma usabilidade facilitada e destinada a pesquisas para identificação de características genéticas únicas em subgrupos de genomas de bactérias que possuem um determinado fenótipo em comum. Os resultados foram validados com dois estudos de caso envolvendo um conjunto com 161 genomas da família Xanthomonadaceae, no qual foram encontradas 19 famílias proteicas ortólogas exclusivas aos genomas associados a plantas e 45 genomas de Streptococcus pyogenes, no qual foram encontrados 15 famílias de proteínas ortólogas que servem como marcadores filogenéticos para a proteína emm.
Referências
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Publicado
15/09/2020
Como Citar
SANTIAGO, Caio R. N.; DIGIAMPIETRI, Luciano A.; MOREIRA, Leandro M..
GTACG: Um arcabouço computacional focado em genômica comparativa de bactérias de um mesmo ramo evolutivo. In: CONCURSO DE TESES E DISSERTAÇÕES - SIMPÓSIO BRASILEIRO DE COMPUTAÇÃO APLICADA À SAÚDE (SBCAS), 20. , 2020, Evento Online.
Anais [...].
Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação,
2020
.
p. 25-30.
ISSN 2763-8987.
DOI: https://doi.org/10.5753/sbcas.2020.11553.
