Um método de Estimação de Expressões Gênicas de Câncer de Mama com Base em Correlação

  • Beatriz A. Rodrigues UFAM
  • Rayol M. Neto UFAM
  • Fabiola F. Nakamura UFAM
  • Eduardo F. Nakamura UFAM

Resumo


Os dados de expressão gênica geralmente sofrem de problemas de valor perdido devido a uma variedade de razões experimentais. Em bases de dados de câncer de mama, a análise subsequente e a classificação de subtipos podem sofrer fortemente com dados omissos, sendo assim é primordial tratar esse problema. Várias abordagens para estimação desses valores em dados de expressão gênica foram desenvolvidas, mas a tarefa é difícil devido a fatores como a existência ou não de uma estrutura de correlação nos dados e à alta dimensionalidade (número de genes x número de amostras) dos dados. Nesta pesquisa, desenvolvemos um método, para tratar valores ausentes em expressões gênicas de cancêr de mama, que lida com a alta dimensinalidade dos dados realizando a seleção de genes que melhor caracterizam o cancêr de mama, a partir do uso de informações de correlação entre genes. O método foi avaliado utilizando as métricas RMSE e MAE.

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Publicado
06/08/2023
RODRIGUES, Beatriz A.; NETO, Rayol M.; NAKAMURA, Fabiola F.; NAKAMURA, Eduardo F.. Um método de Estimação de Expressões Gênicas de Câncer de Mama com Base em Correlação. In: SEMINÁRIO INTEGRADO DE SOFTWARE E HARDWARE (SEMISH), 50. , 2023, João Pessoa/PB. Anais [...]. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação, 2023 . p. 107-118. ISSN 2595-6205. DOI: https://doi.org/10.5753/semish.2023.229914.