mirtronDB: a mirtron knowledge base

  • Bruno Henrique Ribeiro da Fonseca UTFPR
  • Douglas Silva Domingues UNESP
  • Alexandre Rossi Paschoal UTFPR

Resumo


Os mirtrons surgem de introns curtos com clivagem atípica usando o mecanismo de splicing. Até hoje não existe um repositório que organiza e centraliza os dados públicos de mitrons. De modo a preencher essa lacuna, apresenta-se o mirtronDB, o primeiro banco de dados dedicado aos mirtrons (http://mirtrondb.cp.utfpr.edu.br). MirtronDB contém um total de 1.407 precursores e 2.426 sequências maduras de mirtron em 18 espécies. MirtronDB é um recurso especializado que disponibiliza a comunidade científica uma plataforma amigável sobre oconhecimento dos mirtron. Este trabalho é baseado na publicação original na Bioinformatics IF: 5,481 (https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btz153).

Palavras-chave: Modelagem e integração dados biológicos, Banco de dados, Mineração de dados, Análise de dados, Bioinformática.

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Publicado
26/06/2019
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DA FONSECA, Bruno Henrique Ribeiro; DOMINGUES, Douglas Silva; PASCHOAL, Alexandre Rossi. mirtronDB: a mirtron knowledge base. In: CONCURSO DE TESES E DISSERTAÇÕES DA SBC (CTD-SBC), 32. , 2019, Belém. Anais do XXXII Concurso de Teses e Dissertações. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação, june 2019 . DOI: https://doi.org/10.5753/ctd.2019.6340.