A Arquitetura do Supercomputador SDumont e os Desafios da Pesquisa Brasileira na Área de Computação de Alto Desempenho
Resumo
O supercomputador Santos Dumont é o quarto maior da América Latina segundo a lista TOP500 com um total de 5.1 petaflops. Ele está hospedado no Laboratório Nacional de Computação Científica (Petrópolis, Brasil), uma unidade de pesquisa do Ministério da Ciência, Tecnologia e Inovação do Brasil. Neste trabalho apresentamos as principais caracterı́sticas do supercomputador, suas áreas e projetos de pesquisa envolvidos, software e portais cientı́ficos acoplados nele, trabalhos em andamento do nosso grupo para otimizar as execuções e informações gerais a usuários potenciais que pretendam submeter projetos nas chamadas para o uso do Santos Dumont.
Palavras-chave:
palestra
Referências
Bez, J. L., Carneiro, A. R., Pavan, P. J., Girelli, V. S., Boito, F. Z., Fagundes, B. A., Osthoff, C., da Silva Dias, P. L., Méhaut, J.-F., and Navaux, P. O. (2020). I/o performance of the santos dumont supercomputer. The International Journal of High Performance Computing Applications, 34(2):227–245.
Cabral, F., Osthoff, C., Souto, R. P., Costa, G. P., de Oliveira, S. L. G., Brandão, D. N., and Kischinhevsky, M. (2018a). An improved openmp implementation of the tvd–hopmoc method based on a cluster of points. In International Conference on Vector and Parallel Processing, pages 132–145. Springer.
Cabral, F. L., Osthoff, C., Souto, R. P., Costa, G. P., de Oliveira, S. L. G., Brandão, D., and Kischinhevsky, M. (2018b). Fine-tuning an openmp-based tvd–hopmoc method using intel parallel studio xe tools on intel xeon architectures. In Latin American High Performance Computing Conference, pages 194–209. Springer.
Ocaña, K., Galheigo, M., Osthoff, C., Gadelha, L., Gomes, A. T. A., De Oliveira, D., Porto, F., and Vasconcelos, A. T. (2019a). Towards a science gateway for bioinformatics: experiences in the brazilian system of high performance computing. In 2019 19th IEEE/ACM International Symposium on Cluster, Cloud and Grid Computing (CCGRID), pages 638–647. IEEE.
Ocaña, K., Osthoff, C., Coelho, M., Galheigo, M., Canuto, I., de Oliveira, D., and de Oliveira, D. (2019b). Performance evaluation of parallel inference of large phylogenetic trees in santos dumont supercomputer: A practical approach. In Latin American High Performance Computing Conference, pages 448–463. Springer.
Ocaña, K. A., Galheigo, M., Osthoff, C., Gadelha Jr, L. M., Porto, F., Gomes, A. T. A., de Oliveira, D., and Vasconcelos, A. T. (2020). Bioinfoportal: A scientific gateway for integrating bioinformatics applications on the brazilian national high-performance computing network. Future Generation Computer Systems, 107:192–214.
Cabral, F., Osthoff, C., Souto, R. P., Costa, G. P., de Oliveira, S. L. G., Brandão, D. N., and Kischinhevsky, M. (2018a). An improved openmp implementation of the tvd–hopmoc method based on a cluster of points. In International Conference on Vector and Parallel Processing, pages 132–145. Springer.
Cabral, F. L., Osthoff, C., Souto, R. P., Costa, G. P., de Oliveira, S. L. G., Brandão, D., and Kischinhevsky, M. (2018b). Fine-tuning an openmp-based tvd–hopmoc method using intel parallel studio xe tools on intel xeon architectures. In Latin American High Performance Computing Conference, pages 194–209. Springer.
Ocaña, K., Galheigo, M., Osthoff, C., Gadelha, L., Gomes, A. T. A., De Oliveira, D., Porto, F., and Vasconcelos, A. T. (2019a). Towards a science gateway for bioinformatics: experiences in the brazilian system of high performance computing. In 2019 19th IEEE/ACM International Symposium on Cluster, Cloud and Grid Computing (CCGRID), pages 638–647. IEEE.
Ocaña, K., Osthoff, C., Coelho, M., Galheigo, M., Canuto, I., de Oliveira, D., and de Oliveira, D. (2019b). Performance evaluation of parallel inference of large phylogenetic trees in santos dumont supercomputer: A practical approach. In Latin American High Performance Computing Conference, pages 448–463. Springer.
Ocaña, K. A., Galheigo, M., Osthoff, C., Gadelha Jr, L. M., Porto, F., Gomes, A. T. A., de Oliveira, D., and Vasconcelos, A. T. (2020). Bioinfoportal: A scientific gateway for integrating bioinformatics applications on the brazilian national high-performance computing network. Future Generation Computer Systems, 107:192–214.
Publicado
19/08/2020
Como Citar
OSTHOFF, Carla et al.
A Arquitetura do Supercomputador SDumont e os Desafios da Pesquisa Brasileira na Área de Computação de Alto Desempenho. In: ESCOLA REGIONAL DE ALTO DESEMPENHO DE SÃO PAULO (ERAD-SP), 11. , 2020, Evento Online.
Anais [...].
Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação,
2020
.
p. 1-5.
DOI: https://doi.org/10.5753/eradsp.2020.16872.
