Uma Metodologia para Estruturação de Laudos Médicos usando Ontologias
Resumo
Nos sistemas informatizados voltados à geração de laudos em radiologia predomina a aquisição e o armazenamento da informação na forma de anotação textual aberta. Um grande desafio enfrentado no desenvolvimento destes sistemas reside na inadequabilidade de ambientes caracterizados por interfaces de preenchimento padronizados e pré-definidos, que restringem fortemente a liberdade do médico na geração de seus relatos; contrastando com a ineficácia de outros ambientes que trabalham com textos abertos, restringindo fortemente as possibilidades de análise futura da informação. Este trabalho tem por objetivo propor uma metodologia de estruturação para a base de laudos radiológicos do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto visando, em trabalhos futuros, construir de forma (semi-)automática um laudo estruturado que permita a extração de conhecimento para facilitar as atividades ligadas ao ensino e pesquisa deste hospital escola. A metodologia proposta foi avaliada em três bases contendo 5000 laudos cada uma e os resultados comparados com uma ontologia padrão.Referências
Aberle, D. R., Dionisio, J. D., McNitt-Gray, M. F., Taira, R. K., Cárdenas, A. F., Goldin, J. G., Brown, K., Figlin, R., and Chu, W. W. (1996). Integrated multimedia timeline of medical images and data for thoracic oncology patients. Radio-Graphics, 16:669–681.
Brank, J., Grobelnik, M., and Mladenić, D. (2007). Automatic Evaluation of Ontologies, chapter 11. In [Kao and Poteet 2007].
Feldman, R. and Sanger, J. (2006). The Text Mining Handbook: Advanced Approaches in Analyzing Unstructured Data. Cambridge University Press.
Gruber, T. R. (1993). A translation approach to portable ontology specifications. Knowledge Acquisition, 5(2):199–220.
Heflin, J., Hendler, J., and Luke, S. (1999). Coping with changing ontologies in a distributed environment. In Proceedings of AAAI-99 Workshop on Ontology Management, pages 74–79. AAAI Press.
Honorato, D. F., Monard, M. C., Lee, H. D., Neto, A. P., and Chung, W. F. (2009). Avaliação de uma metodologia de mapaemento de laudos médicos para uma representação estruturada: estudo de caso com laudos de endoscopia digestiva alta. WIM - IX Workshop de Informática Médica.
Kao, A. and Poteet, S. R., editors (2007). Natural Language Processing and Text Mining. Springer.
Mitchell, T. M. (1997). Machine Learning. McGraw–Hill.
Shortliffe, E. H. and Hubbard, S. M. (1989). Information systems in oncology. In: De Vita VT, Hellman S, Rosenberg S, eds. Cancer: principles and practice of oncology.
Soares, M. V., Prati, R. C., and Monard, M. C. (2008). Pretext ii: Descrição da reestruturacão da ferramenta de pré-processamento de textos. Technical Report 333, ICMC-USP, São Carlos - SP.
Sowa, J. (2000). Knowledge Representation: Logical, Philosophical, and Computational Foundations. Brooks Cole Publishing Co., Pacific Grove, CA.
Taira, R. K., Soderland, S. G., and Jakobovits, R. M. (2001). Automatic structuring of radiology free-text reports. RadioGraphics, 21:237–245.
Zhang, J., Silvescu, A., and Honavar, V. G. (2002). Ontology-driven induction of decision trees at multiple levels of abstraction. In Proceedings of the 5th International Symposium on Abstraction, Reformulation and Approximation, pages 316–323, London, UK. Springer-Verlag.
Brank, J., Grobelnik, M., and Mladenić, D. (2007). Automatic Evaluation of Ontologies, chapter 11. In [Kao and Poteet 2007].
Feldman, R. and Sanger, J. (2006). The Text Mining Handbook: Advanced Approaches in Analyzing Unstructured Data. Cambridge University Press.
Gruber, T. R. (1993). A translation approach to portable ontology specifications. Knowledge Acquisition, 5(2):199–220.
Heflin, J., Hendler, J., and Luke, S. (1999). Coping with changing ontologies in a distributed environment. In Proceedings of AAAI-99 Workshop on Ontology Management, pages 74–79. AAAI Press.
Honorato, D. F., Monard, M. C., Lee, H. D., Neto, A. P., and Chung, W. F. (2009). Avaliação de uma metodologia de mapaemento de laudos médicos para uma representação estruturada: estudo de caso com laudos de endoscopia digestiva alta. WIM - IX Workshop de Informática Médica.
Kao, A. and Poteet, S. R., editors (2007). Natural Language Processing and Text Mining. Springer.
Mitchell, T. M. (1997). Machine Learning. McGraw–Hill.
Shortliffe, E. H. and Hubbard, S. M. (1989). Information systems in oncology. In: De Vita VT, Hellman S, Rosenberg S, eds. Cancer: principles and practice of oncology.
Soares, M. V., Prati, R. C., and Monard, M. C. (2008). Pretext ii: Descrição da reestruturacão da ferramenta de pré-processamento de textos. Technical Report 333, ICMC-USP, São Carlos - SP.
Sowa, J. (2000). Knowledge Representation: Logical, Philosophical, and Computational Foundations. Brooks Cole Publishing Co., Pacific Grove, CA.
Taira, R. K., Soderland, S. G., and Jakobovits, R. M. (2001). Automatic structuring of radiology free-text reports. RadioGraphics, 21:237–245.
Zhang, J., Silvescu, A., and Honavar, V. G. (2002). Ontology-driven induction of decision trees at multiple levels of abstraction. In Proceedings of the 5th International Symposium on Abstraction, Reformulation and Approximation, pages 316–323, London, UK. Springer-Verlag.
Publicado
19/07/2011
Como Citar
NETTO, Oscar Picchi; MACEDO, Alessandra Alaniz; MARQUES, Paulo Mazzoncini de Azevedo; BARANAUSKAS, José Augusto.
Uma Metodologia para Estruturação de Laudos Médicos usando Ontologias. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE COMPUTAÇÃO APLICADA À SAÚDE (SBCAS), 11. , 2011, Natal/RN.
Anais [...].
Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação,
2011
.
p. 1816-1825.
ISSN 2763-8952.