Desenvolvimento e Integração de Ontologias: um Estudo de Caso em Doenças Humanas
Resumo
A abordagem QDAontology - Quality Driven Approach for e -Science Ontologies é composta por etapas, atividades, participantes, artefatos e características de qualidade. Cada etapa é constituída de atividades, onde são gerados artefatos e os participantes estão relacionados com as etapas e atividades. Com a implementação da ontologia a mesma deve ser integrada a outras ontologias, através de mecanismos de correspondência ontológica. Neste artigo descrevemos o processo de Integração de ontologias e ilustramos com um estudo de caso no domínio biológico com a ontologia CelO-Human Disease.
Referências
API OBO. 2010. API OBO. Disponível em [link]. Acesso em 10 de janeiro de 2010.
Campos, M. L. A., Campos, M. L. M., Dávila, A. M. R., Gomes, H. E., Campos, L. M., Lira, L. Aspectos Metodológicos no Reuso de Ontologias: um estudo a partir das anotações genômicas no domínio dos tripanosomatídeos. 2009. In RECIIS – R. Eletr. de Com. Inf. Inov. Saúde. Rio de Janeiro, v.3, n.1, p.64-75.
CellML.2010. Cell Markup Language. Disponível em [link]. Acesso em 15 de março de 2010.
Cech, P. (2009). Ontology as an Integ rating Element in an Information-Knowledge Infrastructure. In: ICTE 2009 – Internacional Conference on Multimedia and ICT in Education. Lisboa – Portugal.
Corcho, O., Fernandez-Lopez, M., Gomez-Perez, A. “Ontological Engineering: What are ontologies and how can we build them?”. In: CARDOSO, J. Semantic Web Services: Theory, Tools and Applications. New York: Information Science Reference. 2007. Cap. 3, p. 44-70.
Eilbeck, K., Lewis, S., Mungall, C. J., Yandell, M., Stein, L., Durbin, R., Ashburner, M. (2005). The Sequence Ontology: A tool for the unification of genome annotations. Genome Biology (2005) 6:R44. Disponível em [link]. Acesso em 19 ago. 2008
Euzenat, J., Shvaiko, P, Ontology Matching, Springer -Verlag, Berlin Heidelberg (DE), 2007.
Fernández, M., Gómez-Pérez, A., Juristo, N. METHONTOLOGY: From Ontological Art Towards Ontological Engineering. 1997. In AAAI Technical Report SS-97-06. Disponível em [link]
Jena. 2010. Jena 2 Ontology API. Disponível em [link]. Acesso em 05 de janeiro de 2010.
Lambrix, P., Tan, H., Jakoniene, V., Strömbäck, L. “Biological Ontologies”. In: Semantic Web: Revolutionizing Knowledge Discovery i n the Life Sciences. New York: Information Science Reference. 2007. Cap. 4, p. 85-99.
Matos, E. E. S., Campos, F., Braga, R., Palazzi, D. CelOWS: a ontology based framework for the provision of semantic web service related to biological models. Journal of Biomedical Informatics, 2009.
OBO Foundry. 2010. “The Open Biomedical Ontologies”. Disponível em [link].
Palazzi, D. C. QDAontology – Abordagem para o desenvolvimento de ontologias em e - Science: um estudo de caso em biologia. Juiz de F ora, 2010. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora. Juiz de Fora, MG, Brasil.
Silva, V. S., Silva, J. C. P., Campos, M. L. M.: A linhamento de Ontologias atravé s do algoritmo de Alinhamento Local de Caminhos. In: Seminário de Pesquisa em Ontologia no Brasil, Niterói, Rio de Janeiro, Brasil. (2008)
Smith, B. Ontology (Science). 2008. In Nature Precedings
Souza, J. F. (2007). Negociação de significado para viabilizar interoperabilidade semântica. 2007. Dissertação (Mestrado) – COPPE, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, 2007.
SOUZA JUNIOR, H. C. Ontologias Emergentes: Uma abordagem para construção de ontologias a partir de mapeamentos ponto-a-ponto. 2008. Dissertação: (mestrado) - Instituto Militar de Engenharia, Rio de Janeiro, 2008
Sure, Y., STAAB, S., STUDER, R. (2002). Methodology for development and employment of ontology based knowledge management applications. SIGMOD Rec. 31, 4 (December 2002), 18-23. [link]
Campos, M. L. A., Campos, M. L. M., Dávila, A. M. R., Gomes, H. E., Campos, L. M., Lira, L. Aspectos Metodológicos no Reuso de Ontologias: um estudo a partir das anotações genômicas no domínio dos tripanosomatídeos. 2009. In RECIIS – R. Eletr. de Com. Inf. Inov. Saúde. Rio de Janeiro, v.3, n.1, p.64-75.
CellML.2010. Cell Markup Language. Disponível em [link]. Acesso em 15 de março de 2010.
Cech, P. (2009). Ontology as an Integ rating Element in an Information-Knowledge Infrastructure. In: ICTE 2009 – Internacional Conference on Multimedia and ICT in Education. Lisboa – Portugal.
Corcho, O., Fernandez-Lopez, M., Gomez-Perez, A. “Ontological Engineering: What are ontologies and how can we build them?”. In: CARDOSO, J. Semantic Web Services: Theory, Tools and Applications. New York: Information Science Reference. 2007. Cap. 3, p. 44-70.
Eilbeck, K., Lewis, S., Mungall, C. J., Yandell, M., Stein, L., Durbin, R., Ashburner, M. (2005). The Sequence Ontology: A tool for the unification of genome annotations. Genome Biology (2005) 6:R44. Disponível em [link]. Acesso em 19 ago. 2008
Euzenat, J., Shvaiko, P, Ontology Matching, Springer -Verlag, Berlin Heidelberg (DE), 2007.
Fernández, M., Gómez-Pérez, A., Juristo, N. METHONTOLOGY: From Ontological Art Towards Ontological Engineering. 1997. In AAAI Technical Report SS-97-06. Disponível em [link]
Jena. 2010. Jena 2 Ontology API. Disponível em [link]. Acesso em 05 de janeiro de 2010.
Lambrix, P., Tan, H., Jakoniene, V., Strömbäck, L. “Biological Ontologies”. In: Semantic Web: Revolutionizing Knowledge Discovery i n the Life Sciences. New York: Information Science Reference. 2007. Cap. 4, p. 85-99.
Matos, E. E. S., Campos, F., Braga, R., Palazzi, D. CelOWS: a ontology based framework for the provision of semantic web service related to biological models. Journal of Biomedical Informatics, 2009.
OBO Foundry. 2010. “The Open Biomedical Ontologies”. Disponível em [link].
Palazzi, D. C. QDAontology – Abordagem para o desenvolvimento de ontologias em e - Science: um estudo de caso em biologia. Juiz de F ora, 2010. Dissertação (Mestrado em Modelagem Computacional) - Universidade Federal de Juiz de Fora. Juiz de Fora, MG, Brasil.
Silva, V. S., Silva, J. C. P., Campos, M. L. M.: A linhamento de Ontologias atravé s do algoritmo de Alinhamento Local de Caminhos. In: Seminário de Pesquisa em Ontologia no Brasil, Niterói, Rio de Janeiro, Brasil. (2008)
Smith, B. Ontology (Science). 2008. In Nature Precedings
Souza, J. F. (2007). Negociação de significado para viabilizar interoperabilidade semântica. 2007. Dissertação (Mestrado) – COPPE, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, 2007.
SOUZA JUNIOR, H. C. Ontologias Emergentes: Uma abordagem para construção de ontologias a partir de mapeamentos ponto-a-ponto. 2008. Dissertação: (mestrado) - Instituto Militar de Engenharia, Rio de Janeiro, 2008
Sure, Y., STAAB, S., STUDER, R. (2002). Methodology for development and employment of ontology based knowledge management applications. SIGMOD Rec. 31, 4 (December 2002), 18-23. [link]
Publicado
20/07/2010
Como Citar
PALAZZI, Daniele; CAMPOS, Fernanda; BRAGA, Regina; COIMBRA, Elaine.
Desenvolvimento e Integração de Ontologias: um Estudo de Caso em Doenças Humanas. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE COMPUTAÇÃO APLICADA À SAÚDE (SBCAS), 10. , 2010, Belo Horizonte/MG.
Anais [...].
Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Computação,
2010
.
p. 1697-1706.
ISSN 2763-8952.
